Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ascl1Q02067 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ascl1Q02067 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms