Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VcpQ01853 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms