Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hoxd1Q01822 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hoxd1Q01822 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Hoxd1Q01822 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hoxd1Q01822 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hoxd1Q01822 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Hoxd1Q01822 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms