Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacna1cQ01815 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacna1cQ01815 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms