Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nme2Q01768 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nme2Q01768 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nme2Q01768 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nme2Q01768 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Nme2Q01768 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme2Q01768 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nme2Q01768 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nme2Q01768 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nme2Q01768 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms