Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HmgcrQ01237 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms