Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gja5Q01231 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gja5Q01231 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms