Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gjb2Q00977 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gjb2Q00977 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms