Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VegfaQ00731 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms