Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F8a1Q00558 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8a1Q00558 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8a1Q00558 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F8a1Q00558 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8a1Q00558 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F8a1Q00558 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms