Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PgrQ00175 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PgrQ00175 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PgrQ00175 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms