Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psmb4P99026 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psmb4P99026 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms