Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nbr1P97432 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nbr1P97432 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms