Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps45P97390 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Vps45P97390 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms