Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Psme1P97371 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psme1P97371 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms