Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec1P97353 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms