Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 4,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PrkdcP97313 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms