Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Mesp1P97309 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms