Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trim43bP86448 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms