Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tubg1P83887 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms