Protein–RNA interactions for Protein: P83503

Nyx, Nyctalopin, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NyxP83503 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NyxP83503 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NyxP83503 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NyxP83503 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NyxP83503 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NyxP83503 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NyxP83503 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NyxP83503 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NyxP83503 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NyxP83503 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NyxP83503 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NyxP83503 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NyxP83503 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms