Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Irx3P81067 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Irx3P81067 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms