Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptprn2P80560 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms