Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cct5P80316 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cct5P80316 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms