Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

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Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Otx1P80205 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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