Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gfi1P70338 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gfi1P70338 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms