Protein–RNA interactions for Protein: P70323

Tbx1, T-box transcription factor TBX1, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1P70323 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tbx1P70323 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms