Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cux2P70298 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux2P70298 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cux2P70298 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms