Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Vamp7P70280 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms