Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NficP70255 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NficP70255 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NficP70255 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NficP70255 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NficP70255 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NficP70255 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NficP70255 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NficP70255 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms