Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tubb4bP68372 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms