Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Crnkl1P63154 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Crnkl1P63154 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms