Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps3P62908 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rps3P62908 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms