Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rab3cP62823 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rab3cP62823 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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