Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vsnl1P62761 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vsnl1P62761 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms