Protein–RNA interactions for Protein: P61460

Depdc5, GATOR complex protein DEPDC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depdc5P61460 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Depdc5P61460 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Depdc5P61460 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms