Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Stx1bP61264 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms