Protein–RNA interactions for Protein: P61166

Tmem258, Transmembrane protein 258, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem258P61166 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Tmem258P61166 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms