Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PlnP61014 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PlnP61014 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PlnP61014 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PlnP61014 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PlnP61014 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PlnP61014 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms