Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sem1P60897 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Sem1P60897 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sem1P60897 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sem1P60897 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
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Sem1P60897 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sem1P60897 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sem1P60897 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Sem1P60897 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Sem1P60897 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sem1P60897 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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