Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rin3P59729 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms