Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Csrnp3P59055 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms