Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rhbdl3P58873 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rhbdl3P58873 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms