Protein–RNA interactions for Protein: P58801

Ripk2, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk2P58801 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ripk2P58801 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms