Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Setd4P58467 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Setd4P58467 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Setd4P58467 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms