Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Smpdl3bP58242 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smpdl3bP58242 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms