Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CtnsP57757 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CtnsP57757 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms