Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TdgP56581 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TdgP56581 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TdgP56581 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TdgP56581 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TdgP56581 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TdgP56581 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TdgP56581 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TdgP56581 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms