Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CckbrP56481 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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