Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irf5P56477 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms